ચાબહાર પોર્ટને લઈને ભારત અને ઈરાન વચ્ચે ડીલ થઈ અને અમેરિકા ચિંતિત થઈ ગયું. અમેરિકી પક્ષે કહ્યું કે ઈરાન સાથે વ્યાપારી સોદા કરનારા કોઈપણ દેશ પર પ્રતિબંધો લાદવામાં આવે તેવી સંભાવના છે. યુએસ સ્ટેટ ડિપાર્ટમેન્ટના ડેપ્યુટી પ્રવક્તા વેદાંત પટેલે કહ્યું કે હું ઈચ્છું છું કે ભારત સરકાર ચાબહાર પોર્ટ અને ઈરાન સાથેના દ્વિપક્ષીય સંબંધોના સંદર્ભમાં તેની વિદેશ નીતિના લક્ષ્યો વિશે વાત કરે. અમેરિકા ભૂતકાળમાં પણ આવું કરી ચૂક્યું છે પરંતુ નવા સમયમાં આ કરવું સરળ નહીં હોય.
ભારતે 1998માં પોખરણમાં પરમાણુ પરીક્ષણ કર્યું ત્યારે અમેરિકા પણ સ્તબ્ધ થઈ ગયું હતું. આર્થિક પ્રતિબંધો સાથે, અમેરિકા દ્વારા ભારત પર અન્ય ઘણા પ્રતિબંધો લાદવામાં આવ્યા હતા. પોતાના અહંકાર પર પડેલા ફટકાનો બદલો લેવા અમેરિકાએ અન્ય દેશોને પણ ભારત પર પ્રતિબંધ લાદવા ઉશ્કેર્યા. અમેરિકાએ ભારતને લોન અને સહાય આપવા પર પ્રતિબંધ મૂક્યો. અમેરિકન કંપનીઓને ભારતમાં વેપાર કરવા અને રોકાણ કરવા પર પ્રતિબંધ મૂકવામાં આવ્યો હતો. ભારતની નિકાસ પર કડક નિયંત્રણો લાદવામાં આવ્યા હતા. યુએસએ ભારતને અવકાશ અને પરમાણુ ઉર્જા સાથે સંબંધિત મહત્વપૂર્ણ ટેક્નોલોજીની ઍક્સેસનો ઇનકાર કર્યો હતો. અમેરિકન કંપનીઓને ભારતને સંરક્ષણ સાધનો અને સોફ્ટવેર વેચવા પર રોક લગાવવામાં આવી હતી. રૂપિયાનું મૂલ્ય ઘટ્યું અને મોંઘવારી વધી. કેટલીક ભારતીય કંપનીઓને ભારે નુકસાન થયું હતું.
વાજપેયી સરકારે અમેરિકાના પ્રતિબંધોનો સખત વિરોધ કર્યો હતો. તેમણે દલીલ કરી હતી કે ભારતની રાષ્ટ્રીય સુરક્ષા માટે પરીક્ષણો જરૂરી છે. વાજપેયીએ અમેરિકા સાથે રાજદ્વારી વાતચીત પણ કરી હતી જેથી પ્રતિબંધો હટાવી શકાય. પ્રતિબંધ બાદ ભારત સામે નવો પડકાર આવ્યો પરંતુ તત્કાલીન વડાપ્રધાન અટલ બિહારી વાજપેયી અડગ રહ્યા. અમેરિકન પ્રતિબંધોનો સામનો કરવાની યોજના બનાવવામાં આવી અને ભારતને સફળતા પણ મળી. થોડા સમય પછી, અમેરિકાના બિલ ક્લિન્ટન વહીવટીતંત્ર દ્વારા મંત્રણાનો પ્રસ્તાવ મૂકવામાં આવ્યો. અમેરિકા વતી નાયબ વિદેશ પ્રધાન સ્ટ્રોબ ટેલ્બોટને વાટાઘાટકાર બનાવવામાં આવ્યા હતા, જ્યારે અટલ બિહારી વાજપેયીએ જસવંત સિંહને વાટાઘાટકાર બનાવ્યા હતા. સ્ટ્રોબ ટેલ્બોટ અને જસવંત સિંહ વચ્ચે ખૂબ જ ગોપનીય વાતચીત થઈ. ટેલ્બોટે એવી શરત મૂકી કે જો ભારત તેનો મિસાઈલ પ્રોગ્રામ બંધ કરશે તો જ અમેરિકા પ્રતિબંધો હટાવશે. ભારતે તેના પરમાણુ અને મિસાઈલ કાર્યક્રમોને પાછો ખેંચવાનો પ્રસ્તાવ સ્વીકાર્યો ન હતો. જસવંત સિંહે ટેલબોટને સમજાવ્યું કે તે અમેરિકાના હિતમાં રહેશે કે ભારત ચીનની પરમાણુ શક્તિનો સામનો કરવા સક્ષમ બને.